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Li S, Wen Z, Ghalandari B, Zhou T, Warden AR, Zhang T, Dai P, Yu Y, Guo W, Liu M, Xie H, Ding X.


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Nov 06,2023

Li S, Wen Z, Ghalandari B, Zhou T, Warden AR, Zhang T, Dai P, Yu Y, Guo W, Liu M, Xie H, Ding X. Single-Cell Immunoblotting based on a Photoclick Hydrogel Enables High-Throughput Screening and Accurate Profiling of Exogenous Gene Expression. Adv Mater. 2021 Jun;33(22):e2101108. doi: 10.1002/adma.202101108. Epub 2021 Apr 25. PMID: 33899289.

本文介紹了一種基于原位微芯片免疫印跡法的單細(xì)胞轉(zhuǎn)染分析芯片(scTAC),用于快速準(zhǔn)確地分析數(shù)千個(gè)個(gè)體宿主細(xì)胞中的外源基因表達(dá)。scTAC 不僅可以將外源基因活性的信息分配給特定的轉(zhuǎn)染細(xì)胞,而
且即使在低共表達(dá)的情況下也能獲得連續(xù)的蛋白質(zhì)表達(dá)。結(jié)果表明,scTAC 可以揭示報(bào)告基因與靶基因之間表達(dá)水平的關(guān)系,有助于評(píng)估瞬時(shí)轉(zhuǎn)染策略的有效性。該方法在研究稀有細(xì)胞信號(hào)通路中的融合蛋白表
達(dá)和下游蛋白表達(dá)的優(yōu)勢(shì)。scTAC 方法清楚地揭示了一個(gè)有趣的現(xiàn)象,即轉(zhuǎn)染的貼壁 MCF-7 細(xì)胞表現(xiàn)出一些干細(xì)胞特征,但它們沒(méi)有干細(xì)胞外觀。細(xì)胞群體本身具有異質(zhì)性,Single cell WB 技術(shù)能夠從單細(xì)胞蛋
白表達(dá)層面直接定量觀測(cè)到基因表達(dá)情況。

空間代謝組學(xué)+蛋白質(zhì)組學(xué)探究肺腺癌治療的新靶點(diǎn)

癌基因KRAS是RAS基因亞家族的一員,RAS基因通常在人類(lèi)癌癥中發(fā)生突變,包括肺腺癌。RAS基因編碼膜定位的G蛋白,是幾個(gè)信號(hào)級(jí)聯(lián)的組成部分,包括Raf-MEK-ERK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。KRAS引起的代謝變化被認(rèn)為在癌癥的增殖和存活中起著至關(guān)重要的作用,但KRAS對(duì)肺腺癌脂肪生成的調(diào)控作用尚不明確。MSI作為一種工具已經(jīng)被廣泛研究,它可以將癌組織與正常組織區(qū)分開(kāi)來(lái),并對(duì)各種腫瘤進(jìn)行分類(lèi)。在本研究中,作者使用解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(DESI-MSI)分析kras驅(qū)動(dòng)的肺代謝,并結(jié)合基因表達(dá)分析、納米級(jí)蛋白質(zhì)組學(xué)和MSI分析來(lái)研究肺癌中KRAS突變和脂質(zhì)特征之間的關(guān)系。證實(shí)了用治療劑阻斷FASN可以防止kras相關(guān)的肺癌細(xì)胞增殖。

2023-09-21

醫(yī)學(xué)一區(qū)頂刊:靶向代謝組學(xué)探究支鏈氨基酸緩解帕金森小鼠的發(fā)病

2022年9月,哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院姚麗芬教授課題組(一作:閆珍珍)在Brain Behavior and Immunity期刊發(fā)表了題為 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果,通過(guò)氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測(cè)序研究方法,發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群代謝的動(dòng)態(tài)變化特征,探究了BCAAs調(diào)節(jié)PD的機(jī)理,描繪了BCAAs影響腸道微生物群和炎癥因子圖譜,為帕金森疾病的深入研究提供了理論依據(jù)。

2023-09-21

iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機(jī)制

“玉露”蟠桃為冷敏感型果實(shí),長(zhǎng)期的低溫冷藏易使果實(shí)出現(xiàn)果肉褐變、絮敗、糖酸比失調(diào)、芳香物質(zhì)喪失等品質(zhì)劣變癥狀,嚴(yán)重影響了果實(shí)的食用和商品價(jià)值,其中果肉褐變是制約桃果實(shí)流通及產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸。氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制果肉褐變,但作用機(jī)理仍需解析。

2023-09-21

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