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iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機制


Time:

Sep 21,2023

前言

“玉露”蟠桃為冷敏感型果實,長期的低溫冷藏易使果實出現(xiàn)果肉褐變、絮敗、糖酸比失調(diào)、芳香物質(zhì)喪失等品質(zhì)劣變癥狀,嚴重影響了果實的食用和商品價值,其中果肉褐變是制約桃果實流通及產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸。氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制果肉褐變,但作用機理仍需解析。

2022年7月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所葉正文團隊在Plant Physiology and Biochemistry發(fā)表了題為 “Controlled atmosphere storage alleviates internal browning in flat peach fruit by regulating energy and sugar metabolisms”的研究成果,基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制蟠桃果實果肉褐變(IB)和能量損耗,增強果實的抗冷性,延長保鮮期。探討能量代謝與果肉褐變作用機制,為解析桃果實抗低溫逆境原理及貯藏保鮮和冷鏈物流技術(shù)的研發(fā)提供理論支撐。
中文標(biāo)題:氣調(diào)貯藏調(diào)控能量和糖代謝延緩果實褐變的機理機制解析

研究對象:蟠桃果實

發(fā)表期刊:Plant Physiology and Biochemistry

影響因子:5.473

發(fā)表時間:2022年7月

運用組學(xué)技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)

研究背景

本研究以冷敏感型“玉露”蟠桃果實為試材,研究氣調(diào)貯藏(3-3.5%氧氣、3-3.5%二氧化碳和93-94%氮氣)對果實褐變、糖含量和ATP、ADP、AMP及能荷的影響;基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對氧化磷酸化途徑、糖酵解途徑和蔗糖-淀粉途徑代謝通路及關(guān)鍵蛋白進行研究,探討能量代謝與果肉褐變作用機制。

技術(shù)流程

研究結(jié)果

1、褐變(IB)指數(shù)
冷藏25+3d和30+3d,對照組果實的褐變指數(shù)分別為22.5% 和 90% ,氣調(diào)貯藏可顯著抑制果實褐變的發(fā)生。
2.糖含量

冷藏期間,CK果實的蔗糖、葡萄糖和果糖含量持續(xù)下降,氣調(diào)貯藏可顯著抑制冷藏和貨架期間果實蔗糖、葡萄糖和果糖含量的降低,且顯著高于對照組果實糖含量。
3.ATP、ADP、AMP含量和能荷

冷藏期間,CK組果實ATP含量和能荷均呈急劇下降趨勢,氣調(diào)貯藏可顯著抑制ATP含量和能荷的下降。CK組和氣調(diào)貯藏組果實ADP含量呈先上升后下降的趨勢,貯藏后期氣調(diào)組果實ADP含量顯著高于CK組果實;CK組和氣調(diào)組果實AMP含量呈先下降后上升再下降的趨勢,貯藏20-30d的氣調(diào)組果實AMP含量顯著高于CK組果實。貨架第3d,氣調(diào)組果實ATP和ADP含量及能荷均顯著高于CK組果實。

關(guān)鍵詞:

蛋白質(zhì)組學(xué),算法,智能型單細胞蛋白分析系統(tǒng)

空間代謝組學(xué)+蛋白質(zhì)組學(xué)探究肺腺癌治療的新靶點

癌基因KRAS是RAS基因亞家族的一員,RAS基因通常在人類癌癥中發(fā)生突變,包括肺腺癌。RAS基因編碼膜定位的G蛋白,是幾個信號級聯(lián)的組成部分,包括Raf-MEK-ERK信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。KRAS引起的代謝變化被認為在癌癥的增殖和存活中起著至關(guān)重要的作用,但KRAS對肺腺癌脂肪生成的調(diào)控作用尚不明確。MSI作為一種工具已經(jīng)被廣泛研究,它可以將癌組織與正常組織區(qū)分開來,并對各種腫瘤進行分類。在本研究中,作者使用解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(DESI-MSI)分析kras驅(qū)動的肺代謝,并結(jié)合基因表達分析、納米級蛋白質(zhì)組學(xué)和MSI分析來研究肺癌中KRAS突變和脂質(zhì)特征之間的關(guān)系。證實了用治療劑阻斷FASN可以防止kras相關(guān)的肺癌細胞增殖。

2023-09-21

醫(yī)學(xué)一區(qū)頂刊:靶向代謝組學(xué)探究支鏈氨基酸緩解帕金森小鼠的發(fā)病

2022年9月,哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院姚麗芬教授課題組(一作:閆珍珍)在Brain Behavior and Immunity期刊發(fā)表了題為 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果,通過氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測序研究方法,發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群代謝的動態(tài)變化特征,探究了BCAAs調(diào)節(jié)PD的機理,描繪了BCAAs影響腸道微生物群和炎癥因子圖譜,為帕金森疾病的深入研究提供了理論依據(jù)。

2023-09-21

iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機制

“玉露”蟠桃為冷敏感型果實,長期的低溫冷藏易使果實出現(xiàn)果肉褐變、絮敗、糖酸比失調(diào)、芳香物質(zhì)喪失等品質(zhì)劣變癥狀,嚴重影響了果實的食用和商品價值,其中果肉褐變是制約桃果實流通及產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸。氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制果肉褐變,但作用機理仍需解析。

2023-09-21

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