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蛋白質(zhì)組學(xué)+脂質(zhì)組學(xué)探究多胺對(duì)非酒精性脂肪肝的預(yù)防機(jī)制


Time:

Sep 21,2023

前言

亞精胺是一種天然的多胺,對(duì)許多物種的健康有好處,可以延長(zhǎng)壽命。脫氧絲氨酸合成酶(DHPS)和脫氧絲氨酸羥化酶(DOHH)是利用亞精胺催化翻譯因子EIF5A (EIF5AH)翻譯后絲氨酸化的關(guān)鍵酶。本研究發(fā)現(xiàn)非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者和小鼠以及用脂肪酸處理的肝細(xì)胞中,肝臟DOHH mRNA表達(dá)降低。

2022年9月,由新加坡國(guó)立大學(xué)醫(yī)學(xué)院在Nature Communications期刊(IF:17.694)發(fā)表了題為“Spermidine-mediated hypusination of translation factor EIF5A improves mitochondrial fatty acid oxidation and prevents non-alcoholic steatohepatitis progression”的文章,該研究運(yùn)用Label free蛋白組學(xué)、LC-MS脂質(zhì)組學(xué)、RT-PCR逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)、WB蛋白免疫印跡分析等多種技術(shù)方式分析了亞精胺對(duì)非酒精性脂肪肝的預(yù)防研究。

研究結(jié)果

1、非酒精性脂肪肝病小鼠肝細(xì)胞中Dhps-Dohh-Eif5aH通路中蛋白下調(diào)

作者研究了NASH飲食模型中的Dhps-Dohh-Eif5aH通路,在該模型中,小鼠被喂養(yǎng)添加了液體果糖(WDF)22的西方飲食。16周后,這些小鼠出現(xiàn)肥胖、胰島素抵抗和NAFLD,這些癥狀與人類早期NASH22的表型相似。與正常日糧(NCD)喂養(yǎng)的對(duì)照組小鼠相比,WDF喂養(yǎng)的小鼠在16周時(shí)肝臟中多胺生物合成和hypusination通路基因的表達(dá)降低了和蛋白的表達(dá)(圖1d), 16周時(shí)Dhps、Dohh和Eif5aH蛋白表達(dá)降低(圖1e,圖S2a)。綜上所述,這些結(jié)果表明,在該小鼠NASH模型中,多胺合成和Dhps-Dohh-Eif5aH通路減少。
2、Eif5a合成酶調(diào)節(jié)肝細(xì)胞的蛋白質(zhì)合成和線粒體功能

為了了解內(nèi)源性Eif5aH在肝細(xì)胞中的作用,作者使用Dohh或Eif5a siRNA在AML12細(xì)胞中敲低它們的表達(dá),發(fā)現(xiàn)Dohh或Eif5a敲低(KD)降低了Eif5aH水平,研究結(jié)果表明,肝細(xì)胞中Dohh或Eif5a的缺失導(dǎo)致Eif5aH水平和蛋白質(zhì)合成降低,線粒體蛋白和DNA減少,線粒體氧化磷酸化(OXPHOS)減少。
3、亞精胺的補(bǔ)充保留了FA處理細(xì)胞中的Eif5aH和蛋白質(zhì)合成

因?yàn)镕A處理的肝細(xì)胞顯示受損的Dhps-Dohh-Eif5a路徑(圖1f–h),作者研究了FA是否會(huì)損害肝細(xì)胞中的蛋白質(zhì)合成。研究結(jié)果顯示,F(xiàn)A處理的細(xì)胞中一般蛋白質(zhì)合成速率受損(圖3a)。為了研究亞精胺的保護(hù)作用,作者利用Label free蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)以及WB蛋白免疫印跡法分析了FA處理以及FA+Spd處理后的細(xì)胞蛋白組,發(fā)現(xiàn)FA + Spd共同處理恢復(fù)了Eif5a(圖3a),同時(shí)恢復(fù)了大多數(shù)被檢測(cè)的線粒體蛋白,而不影響它們的mRNA水平(圖3b),表明亞精胺可能增加FA處理細(xì)胞中Eif5a蛋白的合成。

接下來,作者評(píng)估了FA + Spd對(duì)mtDNA、細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)含量和線粒體活性氧(ROS)的影響,發(fā)現(xiàn)FA降低了mtDNA,增加了BODIPY和MitoSOX熒光,而亞精胺部分逆轉(zhuǎn)了mtDNA和BODIPY熒光(圖3e、f),以及完全反轉(zhuǎn)的MitoSOX熒光(圖3g)。這些數(shù)據(jù)表明,亞精胺還恢復(fù)了FA處理細(xì)胞中的線粒體數(shù)量,降低了細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)含量和ROS。

關(guān)鍵詞:

蛋白質(zhì)組學(xué),算法,智能型單細(xì)胞蛋白分析系統(tǒng)

空間代謝組學(xué)+蛋白質(zhì)組學(xué)探究肺腺癌治療的新靶點(diǎn)

癌基因KRAS是RAS基因亞家族的一員,RAS基因通常在人類癌癥中發(fā)生突變,包括肺腺癌。RAS基因編碼膜定位的G蛋白,是幾個(gè)信號(hào)級(jí)聯(lián)的組成部分,包括Raf-MEK-ERK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。KRAS引起的代謝變化被認(rèn)為在癌癥的增殖和存活中起著至關(guān)重要的作用,但KRAS對(duì)肺腺癌脂肪生成的調(diào)控作用尚不明確。MSI作為一種工具已經(jīng)被廣泛研究,它可以將癌組織與正常組織區(qū)分開來,并對(duì)各種腫瘤進(jìn)行分類。在本研究中,作者使用解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(DESI-MSI)分析kras驅(qū)動(dòng)的肺代謝,并結(jié)合基因表達(dá)分析、納米級(jí)蛋白質(zhì)組學(xué)和MSI分析來研究肺癌中KRAS突變和脂質(zhì)特征之間的關(guān)系。證實(shí)了用治療劑阻斷FASN可以防止kras相關(guān)的肺癌細(xì)胞增殖。

2023-09-21

醫(yī)學(xué)一區(qū)頂刊:靶向代謝組學(xué)探究支鏈氨基酸緩解帕金森小鼠的發(fā)病

2022年9月,哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院姚麗芬教授課題組(一作:閆珍珍)在Brain Behavior and Immunity期刊發(fā)表了題為 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果,通過氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測(cè)序研究方法,發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群代謝的動(dòng)態(tài)變化特征,探究了BCAAs調(diào)節(jié)PD的機(jī)理,描繪了BCAAs影響腸道微生物群和炎癥因子圖譜,為帕金森疾病的深入研究提供了理論依據(jù)。

2023-09-21

iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機(jī)制

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2023-09-21

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