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空間代謝組學(xué)+蛋白質(zhì)組學(xué)探究肺腺癌治療的新靶點(diǎn)
癌基因KRAS是RAS基因亞家族的一員，RAS基因通常在人類癌癥中發(fā)生突變，包括肺腺癌。RAS基因編碼膜定位的G蛋白，是幾個(gè)信號(hào)級(jí)聯(lián)的組成部分，包括Raf-MEK-ERK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。KRAS引起的代謝變化被認(rèn)為在癌癥的增殖和存活中起著至關(guān)重要的作用，但KRAS對肺腺癌脂肪生成的調(diào)控作用尚不明確。MSI作為一種工具已經(jīng)被廣泛研究，它可以將癌組織與正常組織區(qū)分開來，并對各種腫瘤進(jìn)行分類。在本研究中，作者使用解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(DESI-MSI)分析kras驅(qū)動(dòng)的肺代謝，并結(jié)合基因表達(dá)分析、納米級(jí)蛋白質(zhì)組學(xué)和MSI分析來研究肺癌中KRAS突變和脂質(zhì)特征之間的關(guān)系。證實(shí)了用治療劑阻斷FASN可以防止kras相關(guān)的肺癌細(xì)胞增殖。
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醫(yī)學(xué)一區(qū)頂刊：靶向代謝組學(xué)探究支鏈氨基酸緩解帕金森小鼠的發(fā)病
2022年9月，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院姚麗芬教授課題組（一作：閆珍珍）在Brain Behavior and Immunity期刊發(fā)表了題為 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果，通過氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測序研究方法，發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群代謝的動(dòng)態(tài)變化特征，探究了BCAAs調(diào)節(jié)PD的機(jī)理，描繪了BCAAs影響腸道微生物群和炎癥因子圖譜，為帕金森疾病的深入研究提供了理論依據(jù)。
iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機(jī)制
“玉露”蟠桃為冷敏感型果實(shí)，長期的低溫冷藏易使果實(shí)出現(xiàn)果肉褐變、絮敗、糖酸比失調(diào)、芳香物質(zhì)喪失等品質(zhì)劣變癥狀，嚴(yán)重影響了果實(shí)的食用和商品價(jià)值，其中果肉褐變是制約桃果實(shí)流通及產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸。氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制果肉褐變，但作用機(jī)理仍需解析。
蛋白質(zhì)組學(xué)+脂質(zhì)組學(xué)探究多胺對非酒精性脂肪肝的預(yù)防機(jī)制
亞精胺是一種天然的多胺，對許多物種的健康有好處，可以延長壽命。脫氧絲氨酸合成酶(DHPS)和脫氧絲氨酸羥化酶(DOHH)是利用亞精胺催化翻譯因子EIF5A (EIF5AH)翻譯后絲氨酸化的關(guān)鍵酶。本研究發(fā)現(xiàn)非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者和小鼠以及用脂肪酸處理的肝細(xì)胞中，肝臟DOHH mRNA表達(dá)降低。
脂質(zhì)組+空間代謝組學(xué)揭示在乳腺癌異種移植中的毒理學(xué)機(jī)制
雙酚F（BPF）是雙酚a（BPA）的主要替代品，已被廣泛使用。雖然已知BPA暴露會(huì)產(chǎn)生各種毒性效應(yīng)，但BPF的毒性仍有待深入研究。本文采用一種綜合方法，包括基于質(zhì)譜（MS）的全局脂質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)以及空間代謝組學(xué)方法，研究BPF的毒性作用及其對乳腺癌異種移植物對腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)組織（肝和腎）的潛在毒理機(jī)制。
免疫學(xué)一區(qū)頂刊：質(zhì)譜流式單細(xì)胞蛋白組學(xué)揭示免疫衰老保守標(biāo)志物
2021年01月，美國華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)在Immunity期刊（IF：43.474）發(fā)表了題為的研究成果，采用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序 (scRNA-seq) ， 單細(xì)胞免疫組庫測序 (TCR, BCR)，質(zhì)譜流式細(xì)胞術(shù) (CyTOF)單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)， 表位轉(zhuǎn)錄組測序 CITE-seq測序等研究方法，全面描述了免疫衰老的細(xì)胞景觀，并發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的衰老細(xì)胞標(biāo)志——表達(dá)CD8 的克隆顆粒酶K (GZMK) 并在物種之間保守的T細(xì)胞。GZMK CD8 T 細(xì)胞的一個(gè)獨(dú)特亞群在在衰老環(huán)境中驅(qū)動(dòng)產(chǎn)生，并且可以通過增加 GZMK 的分泌而促成免疫衰老表型。這一系列工作提示GZMK 細(xì)胞有望成為解決年齡相關(guān)免疫系統(tǒng)功能障礙的潛在靶細(xì)胞。
4D蛋白組單細(xì)胞測序+轉(zhuǎn)錄組+代謝組+甲基化轉(zhuǎn)錄組科研人的七夕CP
復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院隋啟海、陳振淙、胡正陽為論文的共同作者，詹成教授、林宗武教授為論文的共同通訊作者，在Journal of Translational Medicine,(IF: 5.531)期刊發(fā)表了關(guān)于順鉑耐藥性研究相關(guān)成果，揭示體細(xì)胞突變、mRNA表達(dá)、miRNA表達(dá)、代謝物和甲基化與順鉑耐藥相關(guān)，同時(shí)基于BATF3、IRF5、ZBTB38三個(gè)基因的表達(dá)建立的模型，可以幫助預(yù)測鉑類藥物特別是含順鉑類藥物化療癌癥患者的反應(yīng)和預(yù)后，歐易生物提供了該篇文章單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相關(guān)工作。
微生物組、代謝組和轉(zhuǎn)錄組揭示宮頸微生物群與宿主基因調(diào)控關(guān)系
接受剖宮產(chǎn)手術(shù)的女性可能會(huì)患上剖宮產(chǎn)瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宮局部切口愈合不良，形成與子宮腔相連的凹陷或空腔，可導(dǎo)致各種近期和遠(yuǎn)期并發(fā)癥，之前的研究表明，持續(xù)性積液是影響 CSD 女性生育能力的主要因素。
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